被逼上绝路的时候选择了投降，不过他的死在历史记载当中是有歧义的。

《明史》等官方史书当中，耿炳文是在投降之后被人弹劾“僭越”，加上他本来是建文帝的托孤大臣，还是朱标的女婿，所以担心被朱棣清算而自杀。

但是在《晋宁州志》当中，《濠梁慎庵耿公墓田碑》又记载的是他在洪武三十二年真定之战当中阵亡。

这也是《明史》对于他阵亡的歧义，不过《明史》当中疑点很多，真假难以判断。